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ionisation d'un peptide

Posté par
sab60
17-05-09 à 10:01

Bonjour

J'ai une question,je doit édutier lévolution de la charge de ce tripeptide (Glu-Gly-Val) en fonction du pH.
Je ne voit pas comment faire avec un tripeptide.
pk1(COOH) pk2(NH2) pkR(chaine latérale)
Glu 2,19    9,67       4,25
Gly 2,34     9;60
Val 2,32     9,62

Car je sait comment on fait pour un peptide mais la c'est un tripeptide et les liaisons hydrogènes m'embètent pour le pk1 car les COOH sautent
Merci de m'aider

Posté par
magisterien
re : ionisation d'un peptide 17-05-09 à 12:21

Bonjour,

Il faut que tu établisses le domaine de prédominance des différents fonctions acide/base du tripeptide.
Sachant que:
pka < ph <=> la concentration de l'acide est plus importante que celle de la base conjuguée
pka > ph <=> la concentration de la base est plus importante que celle de l'acide conjugué
pka = ph les deux sont équivalentes.

Si pk1 > ph alors tu auras majoritairement COO- en solution ! Ce qui signifie une charge -..

Posté par
sab60
re : ionisation d'un peptide 17-05-09 à 12:41

Merci de votre réponce
Mais faut t'il que je dessine le tripeptide ou juste que j'étudier en fonction des pKa?

Posté par
magisterien
re : ionisation d'un peptide 17-05-09 à 12:59

On te demande simplement l'évolution de la charge.
Tu peux faire un axe qui porte la valeur du ph et tu le divise en intervalle qui correspondent aux zones d'existence des acide et des bases pour les 3 acides aminés et tu peux visualiser ainsi la charge globale du tripeptide en additionnant dans chaque zone la charge des trois acides aminés.

Posté par
sab60
re : ionisation d'un peptide 17-05-09 à 14:14

mais on me donnne pas de pH c'est ca qui m'nenuye


_______________|(pH acide)___________________________|(pH basique)______________________
   cooH                       coo -

Je n'arrive pas du tout a visualiser

Posté par
magisterien
re : ionisation d'un peptide 17-05-09 à 14:42

Justement, tu dois regarder comment varie les molécules quand TOI tu fais varier le ph

0 -----2,19----------2,32----------2,34-----------------------------------> ph
glu(COO-) | glu(COOH) | glu(COOH)
gly(COO-) | gly(COO-) | gly(COO-)
val(COO-) | val(COO-) | val(COOH)

J'ai pas tout fait, faut faire pour NH2 etc.. et pour toutes les autres valeurs des pka.

Posté par
sab60
re : ionisation d'un peptide 17-05-09 à 14:53

d'accord je comprend beaucoup mieu.
je vais le faire alors.
Je vous remercie beaucoup.
merci

Posté par
sab60
re : ionisation d'un peptide 17-05-09 à 15:07

je vais vous écrire ce que j'ai trouver

Posté par
sab60
re : ionisation d'un peptide 17-05-09 à 15:18

   0-----2,19------2.32-----2.34------4.25------9.60-------9.62-----9.67------>(pH)
                                           COOH(caîne latéral)
glu (COO-) | (COOH) | (COOH)    |COOH     |COOH      |NH2      |NH2    |NH2
gly (COO-) | (COO-) | (COO-)    |COOH     |COOH      |NH3+     |NH3+   |NH2
val (COO-) | (COO-) | (COOH)    |COOH     |COOH      |NH3+     |NH2    |NH2

Mais je doit en déduire la valeur isométrique mais il n'y a pas  d'égalité des charges

Posté par
magisterien
re : ionisation d'un peptide 17-05-09 à 15:25

Les fonctions amines existent aussi pour un ph inférieur à 9.60 et inversement pour la fonction carboxylique.
Fais le bilan des charges présentes dans la molécule (glu-gly-val) pour déterminer sa charge totale en fonction du ph.

Posté par
sab60
re : ionisation d'un peptide 17-05-09 à 15:44

d'accord.
Je recommence sur ma feuille et je vous tient au courant
                                                                                                                                        

Posté par
sab60
re : ionisation d'un peptide 17-05-09 à 15:45

je trouve une charge neutre entre 2.19 et 2.32
Donc pour son pHi je fais (2.19+2.32)/2



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