Bonjour
Excellente question qui ne manque pas de subtilité !
A mon avis, il faut distinguer deux choses :
1° :  Le modèle du gaz parfait habituellement utilisé en  thermodynamique macroscopique : il s'agit d'un gaz idéal qui possède les deux propriétés suivantes :
- vérifier l'équation d'état bien connue
- vérifier les deux lois de Joule : (U et H ne dépendant que de T)
Ce modèle a l'avantage de bien représenter la réalité tant que la pression des gaz reste faible et que les conditions de température et de pression sont éloignées des conditions de liquéfactions.
2° : le modèle du gaz parfait utilisé en thermodynamique statistique qui est un peu plus restrictif : le gaz est nécessairement homogène : la pression et la température gardent des valeurs identiques en tout point du gaz. Il s'agit d'une approximation valide lorsque les dimensions du récipient contenant le gaz sont faibles : les variations de T et p avec l'altitude peuvent être négligées.
D'ailleurs, de façon générale, tu fais souvent cette approximation, lorsque tu considères un gaz enfermé dans un cylindre par exemple. Tu la fais à chaque fois que tu parles de LA température et de LA pression du gaz sans préciser en quel point du gaz les mesures sont faites...
Bref : il te suffit de rajouter dans ton cours que la théorie faite ne s'applique qu'aux gaz parfaits homogènes...